Elle est dotée d'un mandat et d'une compétence nécessaire pour assurer une coordination efficace et effective des activités des institutions nationales ayant trait directement à la navigation intérieure d'intérêt international.
Toutefois il sied de faire remarquer que l'Accord sus mentionné en tant que cadre juridique régissant la Commission, avait insuffisamment pris en compte la dimension de la gestion intégrée des ressources en eau, notamment dans la globalité du cycle de l'eau et de ses usages.
L'ensemble des problèmes liés à la gouvernance et à l'utilisation de l'eau sont autant de défis qui ne peuvent plus désormais être abordés de façon sectorielle ou localisée, ni séparément les uns des autres.
Ces défis sont :
Pour y faire face, l'Additif à l'Accord Instituant un Régime Fluvial Uniforme et créant la Commission Internationale du Bassin Congo-Oubangui-Sangha (CICOS) a été élaboré par des Experts en eau, approuvé par le Comité des Ministres de la CICOS à l'effet d'adopter les principes de gestion intégrée des ressources en eau. Ce cadre juridique complémentaire confère à la CICOS les compétences d'une véritable Autorité de Bassin de plein exercice.